内容玉石类丹砂云母玉泉钟乳矾石硝石朴硝石石胆空青太一禹余粮白石英紫石英五石脂赤符黄符白符黑符白青扁青雄黄硫黄水银磁石凝水石阳起石孔公孽理石长石白矾石戎盐卤咸白垩石流赤草木类菖蒲菊华人参术菟丝实牛膝委萎
序发凡卷一补养之剂六味地黄丸附桂八味丸知柏八味丸七宝美髯丹还少丹黑地黄丸虎潜丸天真丸三才封髓丹大造丸补天丸人参固本丸参乳丸天王补心丹孔圣枕中丹大补阴丸滋肾丸（又名通关丸）斑龙丸龟鹿二仙膏补火丸唐郑相国
序一序二序三凡例寒性药品苦参升麻葛根柴胡前胡甘草黄连黄芩黄柏知母干地黄熟地黄芍药（白赤）大黄青皮枳壳枳实猪苓泽泻木通栝蒌桑白皮葶苈子滑石薄荷防风天门冬麦门冬牡丹皮红蓝花苏木栀子桃仁连翘地榆石膏马兜铃枇
巢氏诸病源候总论
管序黄序总论十二时气血流注歌发散方十三味总方十四味加减方七厘散飞龙夺命丹地鳖紫金丹三十六大穴图说少林寺秘传内外损伤主方损伤补药方王瑞柏损伤用药论十全大补汤四物汤四君子汤八珍汤补中益气汤六君子汤加味承气
广温疫论
绪言第一卷温热总论论温热四时皆有（添加）论温热五种辨法论温热与风寒各异论温热伏气与新感不同（添加）论温热即是伏火（添加）论湿火之症治论燥火之症治论温热本症疗法（添加）论温热兼症疗法其一兼风其二兼寒其三
弁言杨序总评卷上卷下书《人身图说》后书《医林改错》后书《医林改错》后读《全体新论》
简介卷之上卷之下
序卷之一温邪门暑邪门伏暑门疟疾门痢疾门黄胆门卷之二中风门肝风痰火门虚劳门吐血门臌胀水肿门卷之三积聚门（附虫积）脘腹痛门噎膈反胃门三消门痰饮门痰喘门卷之四咳嗽门疝气门遗精淋浊门痉厥门杂病门妇人门产后门幼